Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms