Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chd5A2A8L1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chd5A2A8L1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chd5A2A8L1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms