Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc1lA2A5N3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pabpc1lA2A5N3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms