Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIF8

Irgm2, Immunity-related GTPase family M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irgm2A0A140LIF8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irgm2A0A140LIF8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irgm2A0A140LIF8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms