Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms