Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms