Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Krt27Q9Z320 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Krt27Q9Z320 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 308.3 ms