Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RfxankQ9Z205 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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RfxankQ9Z205 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RfxankQ9Z205 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RfxankQ9Z205 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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RfxankQ9Z205 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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RfxankQ9Z205 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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RfxankQ9Z205 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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RfxankQ9Z205 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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RfxankQ9Z205 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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RfxankQ9Z205 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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RfxankQ9Z205 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RfxankQ9Z205 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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