Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Uso1Q9Z1Z0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms