Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cib1Q9Z0F4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cib1Q9Z0F4 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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