Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpc6Q9R087 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms