Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col4a4Q9QZR9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms