Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ripk3Q9QZL0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ripk3Q9QZL0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ripk3Q9QZL0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms