Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm10419-201ENSMUST00000100944 1671 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm17910-201ENSMUST00000211038 838 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gpc1Q9QZF2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms