Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms