Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH6

Txnrd1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd1Q9JMH6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Txnrd1Q9JMH6 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms