Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rabgef1Q9JM13 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rabgef1Q9JM13 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rabgef1Q9JM13 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rabgef1Q9JM13 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rabgef1Q9JM13 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rabgef1Q9JM13 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rabgef1Q9JM13 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rabgef1Q9JM13 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Rabgef1Q9JM13 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Rabgef1Q9JM13 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Rabgef1Q9JM13 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Rabgef1Q9JM13 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Rabgef1Q9JM13 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.4 ms