Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ybx3Q9JKB3 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms