Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp29Q9ES63 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms