Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

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Length 537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm30173-201ENSMUST00000195035 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnn1Q9EQR3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm15071-201ENSMUST00000118189 1366 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Kcnn1Q9EQR3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 3110056K07Rik-201ENSMUST00000127129 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm8048-201ENSMUST00000182555 996 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnn1Q9EQR3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 231.9 ms