Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Mrpl4Q9DCU6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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