Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk1dQ9DC28 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms