Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smg9Q9DB90 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Smg9Q9DB90 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Smg9Q9DB90 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Smg9Q9DB90 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Smg9Q9DB90 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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