Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Med27Q9DB40 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Med27Q9DB40 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med27Q9DB40 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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