Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pop5Q9DB28 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms