Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzd9Q9D9M4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms