Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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