Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Alkbh4Q9D8F1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Alkbh4Q9D8F1 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Alkbh4Q9D8F1 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Alkbh4Q9D8F1 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Alkbh4Q9D8F1 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Alkbh4Q9D8F1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Alkbh4Q9D8F1 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Alkbh4Q9D8F1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Alkbh4Q9D8F1 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Alkbh4Q9D8F1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Alkbh4Q9D8F1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Alkbh4Q9D8F1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Alkbh4Q9D8F1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Alkbh4Q9D8F1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Alkbh4Q9D8F1 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Alkbh4Q9D8F1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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