Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Jam3Q9D8B7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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