Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc81Q9D5W4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms