Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PudpQ9D5U5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PudpQ9D5U5 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PudpQ9D5U5 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PudpQ9D5U5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PudpQ9D5U5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PudpQ9D5U5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PudpQ9D5U5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PudpQ9D5U5 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PudpQ9D5U5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PudpQ9D5U5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PudpQ9D5U5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PudpQ9D5U5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PudpQ9D5U5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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PudpQ9D5U5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PudpQ9D5U5 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms