Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt20Q9D312 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms