Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf128Q9D304 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms