Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Snapc3Q9D2C9 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Snapc3Q9D2C9 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms