Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G1

Rab1b, Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1bQ9D1G1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab1bQ9D1G1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms