Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pfdn1Q9CWM4 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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