Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Atxn3Q9CVD2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Atxn3Q9CVD2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Atxn3Q9CVD2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Atxn3Q9CVD2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Atxn3Q9CVD2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Atxn3Q9CVD2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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