Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ifitm3Q9CQW9 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ifitm3Q9CQW9 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms