Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ykt6Q9CQW1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ykt6Q9CQW1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ykt6Q9CQW1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ykt6Q9CQW1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ykt6Q9CQW1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ykt6Q9CQW1 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ykt6Q9CQW1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ykt6Q9CQW1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ykt6Q9CQW1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ykt6Q9CQW1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ykt6Q9CQW1 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ykt6Q9CQW1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ykt6Q9CQW1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms