Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nudt21Q9CQF3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nudt21Q9CQF3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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