Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms