Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SrrtQ99MR6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms