Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms