Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gdpd3Q99LY2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms