Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nus1Q99LJ8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms