Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlgn1Q99K10 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlgn1Q99K10 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms