Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn16Q925N4 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn16Q925N4 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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