Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Zcchc18Q8VD24 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zcchc18Q8VD24 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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