Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn4Q8VCH8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms