Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Vrk3Q8K3G5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vrk3Q8K3G5 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms